De Volta A Konoha
Itachi e Kisame aparecem após a invasão da Areia e do Som, e ambos ficam supresos que só Orochimaru tenha feito isso. A missão dele com Hoshigaki Kisame foi de capturar o Jinchuuriki da Kyuubi, Uzumaki Naruto, dentro do vilarejo de Aldeia da folha. Ele se espanta ao ouvir o nome Uchiha Sasuke. Yuuhi Kurenai e Sarutobi Asuma param os dois Akatsukis, e começam a lutar. Facilmente, Itachi lidera a luta,Kisame lutava combatia Asuma e suas Chakras Blades,que eram dominadas pela Samehada de Kisame,Itachi cai em um genjutsu mas logo faz que ele volte contra Kurenai,quando ia a matar estranhamente só faz ela desmaiar com um chute que a lança na água,Quando Kisame iria matar Asuma,Hatake Kakashi aparece imediatamente copia a tecnica com seu Sharigan,logo apos isso luta com Itachi.Itachi usa seu Tsukuyomi em Hatake Kakashi, que é derrotado facilmente, mas estranhamente Uchiha Itachi não o mata, deixando-o vivo. Maito Gai aparece, e segura Hatake Kakashi. Ele fala para Uchiha Itachi que chamou todo o esquadrão da ANBU para lutar contra ele, e então Uchiha Itachi resolve ir embora com Hoshigaki Kisame, pois não foi lá para começar uma guerra contra o vilarejo de Aldeia da folha.
Uchiha Itachi ainda não desistiu de seu objetivo, e vai atrás de Uzumaki Naruto. Ele fica espantado ao saber que Jiraiya está com ele. Uchiha Itachi acha que eles (ele e Hoshigaki Kisame) não devem enfrentar Jiraiya mesmo sendo dois contra um, pois eles podem sair mortos já que Jiraiya é um dos Sannin. Logo, eles usam uma mulher para distrair Jiraiya. Eles conseguem se aproximar de Uzumaki Naruto, mas Jiraiya chega e os interrompe. De repente, Uchiha Sasuke aparece, e diz que irá matar Uchiha Itachi. Uchiha Itachi prende seu irmão, e diz que ainda lhe falta ódio, e então aplica o Tsukuyomi. Jiraiya usa seu Gamaguchi Shibari, aproveitando-se da distração de Uchiha Itachi com o seu irmão, Uchiha Sasuke. Só que Uchiha Itachi abre um rombo gigantesco com o seu poderoso Amaterasu, e parte com Hoshigaki Kisame. Hoshigaki Kisame então lhe pergunta porque ele não acaba com eles logo de uma vez, e Uchiha Itachi fala que eles não precisam se importar com o Uzumaki Naruto fraco de agora, e que ele precisa se restabelecer por um tempo.